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Ressources humaines
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PCR Quantitative

Objectifs

Formation à PCR quantitative dans le cadre de la mesure de l’expression de gènes.
Formation à l’utilisation des différents logiciels à partir de données communes ou propres à l’utilisateur.

Pré-requis

Aucun

Public

Cette formation s'adresse aux personnes ayant accès à un Light cycler 480 de ROCHE.

Programme

Mercredi 15 mai 2019 : Rappels sur les principes de base de la PCR quantitative
Techniques utilisant le SYBR-Green ou les sondes TAQMAN
Notion de CT
Mercredi 15 mai 2019 : Variables les plus importantes à considérer en qPCR
Choix des amorces : initiation au dessin d’amorces (travaux dirigés sur PC)
Importance de la normalisation : validation des gènes de référence (Genorm & Normfinder ; travaux dirigés et pratiques sur PC et LC480)
L’efficacité en Qpcr : Calcul des efficacités (travaux dirigés sur PC et LC480). Méthode de courbes standard et Linreg
Jeudi 16 mai 2019 : Méthode de quantification: (travaux dirigés et pratiques sur PC et LC480) :
Méthode de la courbe standard
Méthode de calcul sans correction des efficacités
Méthode de calcul avec correction des efficacités
Jeudi 16 mai 2019 : Conclusions et discussions
Conclusion sur l’importance des gènes de références, des contrôles et du nombre de replicats.
Stratégie de détermination de l'efficacité
Qualité et intégrité des ARN et la reverse transcription
Conception d'une expérience de RT PCRq (mélange réactionnel, programmation du LC 480
"Trucs & astuces"
Vendredi matin 17 mai 2019 : La technique HRM, une méthode de génotypage à haut débit
Principes et notion de courbe de fusion
Initiation & interprétation des résultats (travaux dirigés et pratiques sur PC et LC480)

Durée

2,5 jours

Intervenants

Esther LECHNER et Abdelmalek ALIOUA

Dates

15, 16 et 17 mai 2019. Clôture des inscriptions : 06 mai 2019

Lieu

Campus de Cronenbourg - Centre d'accueil des chercheurs - Bât 40 - Salle interactive - 23 rue du Loess - 67200 Strasbourg

Informations

Ressources humaines > Pôle formation
Mme ISABELLE COLRAT-VON
formation@alsace.cnrs.fr